Сравнивая сбор (tidyr) с расплавом (reshape2)

Мне нравится пакет reshape2, потому что это сделало жизнь настолько простой. Как правило, Хэдли сделал улучшения в своих предыдущих пакетах, которые позволяют упростить и ускорить работу кода. Я решил, что я дам tidyr вихрь, и из того, что я прочитал, я думал, что gather был очень похож на melt от reshape2. Но после прочтения документации я не могу получить gather для выполнения той же задачи, что и melt.

Просмотр данных

Здесь вид данных (фактические данные в форме dput в конце сообщения):

  teacher yr1.baseline     pd yr1.lesson1 yr1.lesson2 yr2.lesson1 yr2.lesson2 yr2.lesson3
1       3      1/13/09 2/5/09      3/6/09     4/27/09     10/7/09    11/18/09      3/4/10
2       7      1/15/09 2/5/09      3/3/09      5/5/09    10/16/09    11/18/09      3/4/10
3       8      1/27/09 2/5/09      3/3/09     4/27/09     10/7/09    11/18/09      3/5/10

код

Здесь код melt, моя попытка в gather. Как сделать gather сделать то же самое, что и melt?

library(reshape2); library(dplyr); library(tidyr)

dat %>% 
   melt(id=c("teacher", "pd"), value.name="date") 

dat %>% 
   gather(key=c(teacher, pd), value=date, -c(teacher, pd))

Желаемый результат

   teacher     pd     variable     date
1        3 2/5/09 yr1.baseline  1/13/09
2        7 2/5/09 yr1.baseline  1/15/09
3        8 2/5/09 yr1.baseline  1/27/09
4        3 2/5/09  yr1.lesson1   3/6/09
5        7 2/5/09  yr1.lesson1   3/3/09
6        8 2/5/09  yr1.lesson1   3/3/09
7        3 2/5/09  yr1.lesson2  4/27/09
8        7 2/5/09  yr1.lesson2   5/5/09
9        8 2/5/09  yr1.lesson2  4/27/09
10       3 2/5/09  yr2.lesson1  10/7/09
11       7 2/5/09  yr2.lesson1 10/16/09
12       8 2/5/09  yr2.lesson1  10/7/09
13       3 2/5/09  yr2.lesson2 11/18/09
14       7 2/5/09  yr2.lesson2 11/18/09
15       8 2/5/09  yr2.lesson2 11/18/09
16       3 2/5/09  yr2.lesson3   3/4/10
17       7 2/5/09  yr2.lesson3   3/4/10
18       8 2/5/09  yr2.lesson3   3/5/10

Данные

dat <- structure(list(teacher = structure(1:3, .Label = c("3", "7", 
    "8"), class = "factor"), yr1.baseline = structure(1:3, .Label = c("1/13/09", 
    "1/15/09", "1/27/09"), class = "factor"), pd = structure(c(1L, 
    1L, 1L), .Label = "2/5/09", class = "factor"), yr1.lesson1 = structure(c(2L, 
    1L, 1L), .Label = c("3/3/09", "3/6/09"), class = "factor"), yr1.lesson2 = structure(c(1L, 
    2L, 1L), .Label = c("4/27/09", "5/5/09"), class = "factor"), 
        yr2.lesson1 = structure(c(2L, 1L, 2L), .Label = c("10/16/09", 
        "10/7/09"), class = "factor"), yr2.lesson2 = structure(c(1L, 
        1L, 1L), .Label = "11/18/09", class = "factor"), yr2.lesson3 = structure(c(1L, 
        1L, 2L), .Label = c("3/4/10", "3/5/10"), class = "factor")), .Names = c("teacher", 
    "yr1.baseline", "pd", "yr1.lesson1", "yr1.lesson2", "yr2.lesson1", 
    "yr2.lesson2", "yr2.lesson3"), row.names = c(NA, -3L), class = "data.frame")

Ответ 1

Ваша строка gather должна выглядеть так:

dat %>% gather(variable, date, -teacher, -pd)

Это говорит: "Соберите все переменные, кроме teacher и pd, вызывая новую ключевую колонку" переменная "и новый столбец значений" дата ".

В качестве пояснения обратите внимание на страницу help(gather):

 ...: Specification of columns to gather. Use bare variable names.
      Select all variables between x and z with ‘x:z’, exclude y
      with ‘-y’. For more options, see the select documentation.

Так как это многоточие, спецификация столбцов для сбора дается как отдельное (голое имя) аргументы. Мы хотим собрать все столбцы, кроме teacher и pd, поэтому мы используем -.

Ответ 2

В tidyr 1.0.0 эта задача решается с помощью более гибкого pivot_longer().

Эквивалентный синтаксис будет

library(tidyr)
dat %>% pivot_longer(cols = -c(teacher, pd), names_to = "variable", values_to = "date")

который, соответственно, говорит: "Поворачивайте все дольше, кроме teacher и pd, вызывая столбец новой переменной" переменная "и столбец нового значения" дата ".

Обратите внимание, что длинные данные возвращаются в порядке первых столбцов предыдущего фрейма данных, которые были повернуты, в отличие от gather, который вернулся в порядке столбца новой переменной. Чтобы переставить результирующий тибль, используйте dplyr::arrange().