Я пытаюсь сделать штриховку, где график упорядочен с miRNA с наивысшим value до miRNA с наименьшим. Почему мой код не работает?
> head(corr.m)
miRNA variable value
1 mmu-miR-532-3p pos 7
2 mmu-miR-1983 pos 75
3 mmu-miR-301a-3p pos 70
4 mmu-miR-96-5p pos 5
5 mmu-miR-139-5p pos 10
6 mmu-miR-5097 pos 47
ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) +
geom_bar(stat="identity")
Ваш код работает нормально, за исключением того, что барплот заказан от низкого до высокого. Если вы хотите заказать столбики от максимума к минимуму, вам нужно добавить знак - перед value:
ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) +
geom_bar(stat = "identity")
который дает:
Использованные данные:
corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))