Я запускаю (био) python script, что приводит к следующей ошибке:
from: can't read /var/mail/Bio
поскольку мой script не имеет ничего общего с почтой, я не понимаю, почему мой script ищет /var/mail.
Какая проблема здесь? Я сомневаюсь, что это поможет, поскольку script, похоже, не проблема, но вот мой script в любом случае:
from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import ProtParam
handle = open("examplefasta.fasta")
for record in SeqIO.parse(handle, "fasta"):
seq = str(record.seq)
X = ProtParam.ProteinAnalysis(seq)
print X.count_amino_acids()
print X.get_amino_acids_percent()
print X.molecular_weight()
print X.aromaticity()
print X.instability_index()
print X.flexibility()
print X.isoelectric_point()
print X.secondary_structure_fraction()
в чем проблема? плохая настройка python? Я действительно не думаю, что это script.