После обновления до bootstrap 2.3.0 я заметил странное поведение всплывающей подсказки.
Если вы введете поле и попытаетесь перейти от него, всплывающая подсказка исчезнет и скроет поле ввода. Эта проблема возникает только с последней версией бутстрапа, не уверен, что именно было изменено, но 2.2.2 хорошо работает с Prototype.
jQuery.noConflict();
jQuery('input[data-content]').popover({
trigger: 'focus'
});
Вот рабочий пример: http://jsfiddle.net/U6EDs/4/