Подтвердить что ты не робот

RcppArmadillo передает пользовательскую функцию

Рассмотрим следующий R-код,

## ----------- R version -----------

caller <- function(x=1:3, fun = "identity", ...){

  ## do some other stuff
  ## ...
  ## then call the function
  eval(call(fun, x))

}

fun1 <- function(x, ...){
  x + x
}

fun2 <- function(x, a = 10) a * x

caller(fun = "fun1")
caller(fun = "fun2")

Пользователь может передать имя функции "fun", которое используется caller. Я хочу выполнить ту же задачу с объектами RcppArmadillo (как часть более сложной задачи, очевидно). Функция будет определена в C++, и пользователь выбирает ее на уровне R, обращаясь к ее имени:

caller_cpp(1:3, "fun1_cpp")

или

caller_cpp(1:3, "fun2_cpp")

и др.

Здесь моя наивная попытка для вызывающей функции, которая даже не скомпилируется:

## ----------- C++ version -----------

library(Rcpp)
require( RcppArmadillo )    

sourceCpp( code = '

       // [[Rcpp::depends("RcppArmadillo")]]

       #include <RcppArmadillo.h>

       using namespace arma ; 
       using namespace Rcpp ;


       colvec fun1_cpp(const colvec x)
      {
       colvec y ;
       y = x + x;
       return (y);
      }

       colvec fun2_cpp(const colvec x)
      {
       colvec y ;
       y = 10*x;
       return (y);
      }

     // mysterious pointer business in an attempt 
     // to select a compiled function by its name

      typedef double (*funcPtr)(SEXP);
      SEXP putFunPtrInXPtr(SEXP funname) {
            std::string fstr = Rcpp::as<std::string>(funname);
            if (fstr == "fun1")
                return(Rcpp::XPtr<funcPtr>(new funcPtr(&fun1_cpp)));
            else if (fstr == "fun2")
            return(Rcpp::XPtr<funcPtr>(new funcPtr(&fun2_cpp)));

       }

       // [[Rcpp::export]]
       colvec caller_cpp(const colvec x, character funname)
      {
       Rcpp::XPtr fun = putFunPtrInXPtr(funname);
       colvec y ;
       y = fun(x);
       return (y);
      }

   ')

Изменить: адаптирован пример после выполнения предложения Dirk, чтобы посмотреть RcppDE.

4b9b3361

ОТВЕТЫ

Ответ 1

(Иногда вам нужно использовать svn log ... для файлов, чтобы узнать, насколько они датированы...)

Я думаю, что лучший вариант использования - это мой "порт" на основе D-кода на основе R на Rcpp/RcppArmadillo: RcppDE. В нем я разрешаю подпрограмме оптимизации использовать либо функцию R (как это делает DEoptim), либо предоставленную пользователем скомпилированную функцию - вот что вы хотите здесь, как я ее понимаю.

Существует небольшая часть лесов С++, но после этого у вас не должно быть никаких проблем.

Изменить в 2013-01-21 Ниже представлено полное решение, которое я также выслал как этот новый пост в галерее Rcpp - включая некоторые комментарии и примеры использования.

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>

using namespace arma; 
using namespace Rcpp;

vec fun1_cpp(const vec& x) {    // a first function 
    vec y = x + x;
    return (y);
}

vec fun2_cpp(const vec& x) {    // and a second function
    vec y = 10*x;
    return (y);
}

typedef vec (*funcPtr)(const vec& x);

// [[Rcpp::export]]
XPtr<funcPtr> putFunPtrInXPtr(std::string fstr) {
    if (fstr == "fun1")
        return(XPtr<funcPtr>(new funcPtr(&fun1_cpp)));
    else if (fstr == "fun2")
        return(XPtr<funcPtr>(new funcPtr(&fun2_cpp)));
    else
        return XPtr<funcPtr>(R_NilValue); // runtime error as NULL no XPtr
}

// [[Rcpp::export]]
vec callViaString(const vec x, std::string funname) {
    XPtr<funcPtr> xpfun = putFunPtrInXPtr(funname);
    funcPtr fun = *xpfun;
    vec y = fun(x);
    return (y);
}

// [[Rcpp::export]]
vec callViaXPtr(const vec x, SEXP xpsexp) {
    XPtr<funcPtr> xpfun(xpsexp);
    funcPtr fun = *xpfun;
    vec y = fun(x);
    return (y);
}