Spring Data MongoRepository save (T) не работает... иногда

Итак, это небольшое приложение Angular + Java + Spring Boot + MongoDB, с которым я работаю. В последнее время он получает довольно много действий (читай: модификации кода), но классы доступа к данным в значительной степени остались нетронутыми AFAIK.
Однако, похоже, MongoRepository внезапно решил прекратить сохранять изменения, которые я save() в DB.

mongod.log это то, что я вижу, когда save() работает:

2018-04-11T15:04:06.840+0200 I COMMAND  [conn6] command pdfviewer.bookData command: find { find: "bookData", filter: { _id: "ID_1" }, limit: 1, singleBatch: true } planSummary: IDHACK keysExamined:1 docsExamined:1 idhack:1 cursorExhausted:1 keyUpdates:0 writeConflicts:0 numYields:1 nreturned:1 reslen:716 locks:{ Global: { acquireCount: { r: 4 } }, Database: { acquireCount: { r: 2 } }, Collection: { acquireCount: { r: 2 } } } protocol:op_query 102ms
2018-04-11T17:30:19.615+0200 I WRITE    [conn7] update pdfviewer.bookData query: { _id: "ID_1" } update: { _class: "model.BookData", _id: "ID_1", config: { mode: "normal", offlineEnabled: true }, metadata: { title: "PDFdePrueba3pag   copia  6 ", ...}, downloaded: false, currentPageNumber: 2, availablePages: 3, bookmarks: [], stats: { _id: "c919e517-3c68-462c-8396-d4ba391762e6", dateOpen: new Date(1523460575872), dateClose: new Date(1523460575951), timeZone: "+2", ... }, ... } keysExamined:1 docsExamined:1 nMatched:1 nModified:1 keyUpdates:0 writeConflicts:1 numYields:1 locks:{ Global: { acquireCount: { r: 2, w: 2 } }, Database: { acquireCount: { w: 2 } }, Collection: { acquireCount: { w: 2 } } } 315ms
2018-04-11T17:30:19.615+0200 I COMMAND  [conn7] command pdfviewer.$cmd command: update { update: "bookData", ordered: false, updates: [ { q: { _id: "ID_1" }, u: { _class: "model.BookData", _id: "ID_1", config: { mode: "normal", offlineEnabled: true }, metadata: { title: "PDFdePrueba3pag   copia  6 ", ...}, downloaded: false, currentPageNumber: 2, availablePages: 3, bookmarks: [], stats: { _id: "c919e517-3c68-462c-8396-d4ba391762e6", dateOpen: new Date(1523460575872), dateClose: new Date(1523460575951), timeZone: "+2", ... }, ... }, upsert: true } ] } keyUpdates:0 writeConflicts:0 numYields:0 reslen:55 locks:{ Global: { acquireCount: { r: 2, w: 2 } }, Database: { acquireCount: { w: 2 } }, Collection: { acquireCount: { w: 2 } } } protocol:op_query 316ms

И это то, что я вижу, когда это не так:

2018-04-11T18:13:21.864+0200 I NETWORK  [initandlisten] connection accepted from 127.0.0.1:64271 #1 (1 connection now open)
2018-04-11T18:18:51.425+0200 I NETWORK  [initandlisten] connection accepted from 127.0.0.1:64329 #2 (2 connections now open)
2018-04-11T18:19:06.967+0200 I NETWORK  [initandlisten] connection accepted from 127.0.0.1:64346 #3 (3 connections now open)

Выполняя tail -f ^₁ в файле журнала во время отладки, я видел, что эти соединения появляются правильно, когда мой код вызывает findById() или save(), поэтому кажется, что приложение может попасть в БД.

Это (более или менее) соответствующий Java-код:

/* BookData.java */
@Document
public class BookData {

    @Id private String id;
    // Some more non-Id Strings...
    private Config config;
    private Metadata metadata;
    private Boolean downloaded;
    private Integer currentPageNumber;
    private int availablePages;
    private List<Bookmark> bookmarks;
    private StatsModel stats;

    @Transient private byte[] contents;

    public BookData() {}

    // getters and setters
}

/* BookDataRepository.java */
// MongoRepository comes from spring-boot-starter-parent-1.4.5.RELEASE
public interface BookDataRepository extends MongoRepository<BookData, String> {
    BookData findById(String id);
}

/* BookDataServiceImpl.java */
public BookData updateBookData(String id, BookData newData) {
    final BookData original = bookDataRepository.findById(id);
    if (original == null) {
        return null;
    }
    original.setCurrentPageNumber(Optional.ofNullable(newData.getCurrentPageNumber()).orElseGet(original::getCurrentPageNumber));
    // similar code for a couple other fields

    return bookDataRepository.save(original);
}

Я прошел через эту часть сто раз во время отладки и все, кажется, в порядке:

• findById(id) корректно возвращает ожидаемый BookData original объект BookData original: проверьте ✓
• newData содержит ожидаемые значения, которые будут использоваться для обновления: проверьте ✓
• прямо перед вызовом save(original), original был правильно изменен с использованием значений newData: проверьте ✓
• save() выполняется без ошибок: проверьте ✓
• save() возвращает новую BookData с правильно обновленными значениями: к моему собственному удивлению, проверьте ✓
• после того, как save() возвращения, db.bookData.find() запрос в Монго Shell показывает, что значения были обновлены: сбой.
• после возврата save() объект BookData полученный новыми вызовами findById() содержит обновленные значения: fail (иногда это происходит, иногда это не так).

Просто похоже, что MongoDB ждет какой-то flush(), но это не репозиторий JPA, где можно было бы вместо этого вызвать saveAndFlush().

Любые идеи, почему это может произойти?

EDIT: версии (по запросу):

• Java 8
• Весенняя игра 1.4.5
• MongoDB 3.2.6
• Windows 10

Я также включил BookData выше.