Я не нашел явного ответа на этот вопрос в документации WiX (или Google, если на то пошло). Конечно, я мог просто написать соответствующие ключи реестра в HKCR, но это заставляет меня чувствовать себя грязным, и я ожидаю, что это будет стандартная задача, которая должна иметь хорошее решение по умолчанию.
Для бонусов я хотел бы знать, как сделать его "безопасным", т.е. не перезаписывать существующие регистрации для типа файла и удалять регистрацию при удалении, только если он был зарегистрирован во время установки и не изменился.