В приведенном ниже минимальном примере я пытаюсь использовать значения символьной строки vars
в формуле регрессии. Однако я могу передать строку имен переменных ( "v2 + v3 + v4" ) в формулу, а не реальный смысл этой строки (например, "v2" равен $v2).
Я знаю, что существуют лучшие способы запуска регрессии (например, lm(v1 ~ v2 + v3 + v4, data=dat)
). Моя ситуация более сложная, и я пытаюсь понять, как использовать символьную строку в формуле. Любые мысли?
Обновлен ниже код
# minimal example
# create data frame
v1 <- rnorm(10)
v2 <- sample(c(0,1), 10, replace=TRUE)
v3 <- rnorm(10)
v4 <- rnorm(10)
dat <- cbind(v1, v2, v3, v4)
dat <- as.data.frame(dat)
# create objects of column names
c.2 <- colnames(dat)[2]
c.3 <- colnames(dat)[3]
c.4 <- colnames(dat)[4]
# shortcut to get to the type of object my full code produces
vars <- paste(c.2, c.3, c.4, sep="+")
### TRYING TO SOLVE FROM THIS POINT:
print(vars)
# [1] "v2+v3+v4"
# use vars in regression
regression <- paste0("v1", " ~ ", vars)
m1 <- lm(as.formula(regression), data=dat)
Обновление:
@Arun был прав относительно отсутствующих "" на v1
в первом примере. Это подтвердило мой пример, но у меня все еще были проблемы с моим реальным кодом. В приведенном ниже фрагменте кода я адаптировал свой пример, чтобы лучше отразить мой фактический код. Я решил создать более простой пример, считая сначала, что проблема была в строке vars
.
Вот пример, который не работает:) Использует тот же фрейм данных dat
, который был создан выше.
dv <- colnames(dat)[1]
r2 <- colnames(dat)[2]
# the following loop creates objects r3, r4, r5, and r6
# r5 and r6 are interaction terms
for (v in 3:4) {
r <- colnames(dat)[v]
assign(paste("r",v,sep=""),r)
r <- paste(colnames(dat)[2], colnames(dat)[v], sep="*")
assign(paste("r",v+2,sep=""),r)
}
# combine r3, r4, r5, and r6 then collapse and remove trailing +
vars2 <- sapply(3:6, function(i) {
paste0("r", i, "+")
})
vars2 <- paste(vars2, collapse = '')
vars2 <- substr(vars2, 1, nchar(vars2)-1)
# concatenate dv, r2 (as a factor), and vars into `eq`
eq <- paste0(dv, " ~ factor(",r2,") +", vars2)
Вот проблема:
print(eq)
# [1] "v1 ~ factor(v2) +r3+r4+r5+r6"
В отличие от regression
в первом примере, eq
не вводит имена столбцов (например, v3
). Имена объектов (например, r3
) сохраняются. Таким образом, следующая команда lm()
не работает.
m2 <- lm(as.formula(eq), data=dat)