Векторизация матрицы

У меня есть большая 2D-матрица размером 1000 x 1000. Я хочу изменить ее так, чтобы она была одним столбцом (или строкой). Например, если матрица была:

Я хочу включить его в:

1 2 3 4 5 6 7 8 9

Мне не нужно сохранять заголовки столбцов, просто порядок данных. Как это сделать, используя reshape2 (который, как я полагал, был самым простым в использовании пакетом)?

Чтобы уточнить, я упомянул reshape, поскольку я думал, что это лучший способ сделать это. Я вижу, что есть более простые методы, которыми я доволен.

Ответ 1

Я думаю, будет сложно найти более компактный метод, чем:

c(m)
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9

Однако, если вы хотите сохранить матричную структуру, то эта переработка атрибута dim будет эффективной:

dim(m) <- c(dim(m)[1]*dim(m)[2], 1)
m
      [,1]
 [1,]    1
 [2,]    2
 [3,]    3
 [4,]    4
 [5,]    5
 [6,]    6
 [7,]    7
 [8,]    8
 [9,]    9

Были бы более компактные методы получения произведения размеров, но указанный выше метод подчеркивает, что атрибут dim является двухэлементным вектором для матриц. Другие способы получения "9" в этом примере:

> prod(dim(m))
[1] 9
> length(m)
[1] 9

Ответ 2

Возможное решение, но без использования reshape2:

> m <- matrix(c(1:9), ncol = 3)
> m
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    1    4    7
[2,]    2    5    8
[3,]    3    6    9
> as.vector(m)
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9

Ответ 3

Давай, ребята, дайте OP решение reshape2:

> m <- matrix(c(1:9), ncol = 3)
> melt(m)$value
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9

Я просто не могу потрудиться, чтобы проверить, насколько он медленнее, чем c (m). Это одно и то же:

> identical(c(m),melt(m)$value)
[1] TRUE

[EDIT: О, черт возьми, кого я шучу:]

> system.time(for(i in 1:1000){z=melt(m)$value})
   user  system elapsed 
  1.653   0.004   1.662 
> system.time(for(i in 1:1000){z=c(m)})
   user  system elapsed 
  0.004   0.000   0.004

Ответ 4

as.vector(m) должен быть немного более эффективным, чем c (m):

> library(rbenchmark)
> m <- diag(5000)
> benchmark(
+   vect = as.vector(m), 
+   conc = c(m), 
+   replications=100
+ )
  test replications elapsed relative user.self sys.self user.child sys.child
2 conc          100  12.699    1.177     6.952    5.754          0         0
1 vect          100  10.785    1.000     4.858    5.933          0         0

Ответ 5

Еще один простой способ сделать это, используя функцию "sapply" (или то же самое можно сделать и с циклом "для" )

 m <- matrix(c(1:9), ncol = 3)
 (m1 <- as.numeric(sapply(1:NROW(m), function(i)(m[,i]))))