R "stats" цитата для научной статьи

Ответ 1

Рецензент ошибочен:

 citation("stats")

The ‘stats’ package is part of R.  To cite R in publications use:

  R Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R
  Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL
  http://www.R-project.org/.

A BibTeX entry for LaTeX users is

  @Manual{,
    title = {R: A Language and Environment for Statistical Computing},
    author = {{R Core Team}},
    organization = {R Foundation for Statistical Computing},
    address = {Vienna, Austria},
    year = {2013},
    note = {{ISBN} 3-900051-07-0},
    url = {http://www.R-project.org/},
  }

We have invested a lot of time and effort in creating R, please cite it when
using it for data analysis. See also ‘citation("pkgname")’ for citing R
packages.

Ответ 2

В нашей недавней книге мой соавтор и я сделали цитату из R (в начале), но также получили издателя, чтобы мы могли также выдайте кредит за пакет:

Мы чувствовали, что важно обеспечить, чтобы те, кто выполнял эту работу, получили кредит на всем протяжении раунда.

(Я wld сделал это только комментарием, но не могу легко вставить пиксел таким образом, и rly не захотел размещать img где-то.)

Ответ 3

Как отметил hrbrmstr, функция создания списка ссылок только загруженных пакетов пригодится. Поскольку он только показал нам пример, а не функцию, я написал один сам, который я часто использую в научных анализах и документах (иногда в сочетании с R Markdown).

citations <- function(includeURL = TRUE, includeRStudio = TRUE) {
    if(includeRStudio == TRUE) {
        ref.rstudio <- RStudio.Version()$citation
        if(includeURL == FALSE) {
            ref.rstudio$url = NULL;
        }
        print(ref.rstudio, style = 'text')
        cat('\n')
    }

    cit.list <- c('base', names(sessionInfo()$otherPkgs))
    for(i in 1:length(cit.list)) {
        ref <- citation(cit.list[i])
        if(includeURL == FALSE) {
            ref$url = NULL;
        }
        print(ref, style = 'text')
        cat('\n')
    }
}

Так, например, после запуска

library(readr)
library(dplyr)
library(ggplot2)
library(knitr)

функция citations() будет печатать:

Команда RStudio (2016). RStudio: интегрированная среда разработки для R. RStudio, Inc., Бостон, Массачусетс. http://www.rstudio.com.

R Core Team (2017). R: Язык и среда для статистических вычислений. R для статистических Computing, Вена, Австрия. https://www.R-project.org.

Xie Y (2016). knitr: пакет общего назначения для генерации динамического отчета в версии R.R версии 1.15.1, http://yihui.name/knitr.

Xie Y (2015). Динамические документы с R и knitr, 2-е издание. Chapman и Hall/CRC, Бока-Ратон, штат Флорида. ISBN 978-1498716963, http://yihui.name/knitr.

Xie Y (2014). "knitr: комплексный инструмент для воспроизводимых исследований в Р." В Stodden V, Leisch F и Peng RD (ред.), Реализация воспроизводимых вычислительных исследований. Чепмен и Холл/КПР. ISBN 978-1466561595, http://www.crcpress.com/product/isbn/9781466561595.

Wickham H (2009). ggplot2: Элегантная графика для анализа данных. Springer-Verlag Нью-Йорк. ISBN 978-0-387-98140-6, http://ggplot2.org.

Wickham H и Francois R (2016). dplyr: грамматика манипулирования данными. R версии 0.5.0, https://CRAN.R-project.org/package=dplyr.

Wickham H, Hester J и Francois R (2016). readr: Чтение табличных данных. R пакет версии 1.0.0, https://CRAN.R-project.org/package=readr.

Ответ 4

Теперь есть пакет grateful, который может быть полезен:

Целью благодарности является очень просто привести R-пакеты используемых в любом отчете или публикации. Вызывая одну функцию, она сканирует проект на использование R-пакетов и создает документ с цитаты в желаемом формате вывода (Word, PDF, HTML, Markdown). Важно отметить, что эти ссылки могут быть отформатированы для конкретного журнала так что мы можем просто вставить их непосредственно в список библиографии наша рукопись или отчет.

https://github.com/Pakillo/grateful

Если пакет stats загружен, ссылку можно получить, выполнив:

library(grateful)
cite_packages()

-assuming grateful уже установлен, запустив:

library(devtools)
install_github("Pakillo/grateful")