Я работаю над разработкой пакета R, используя devtools, testthat и roxygen2. У меня есть несколько наборов данных в папке с данными (foo.txt и bar.csv).
Моя файловая структура выглядит следующим образом:
/ mypackage
/ data
* foo.txt, bar.csv
/ inst
/ tests
* run-all.R, test_1.R
/ man
/ R
Я уверен, что "foo" и "bar" задокументированы правильно:
#' Foo data
#'
#' Sample foo data
#'
#' @name foo
#' @docType data
NULL
#' Bar data
#'
#' Sample bar data
#'
#' @name bar
#' @docType data
NULL
Я хотел бы использовать данные в 'foo' и 'bar' в моих примерах документации и модульных тестах.
Например, я хотел бы использовать эти наборы данных в тестах testthat, вызывая:
data(foo)
data(bar)
expect_that(foo$col[1], equals(bar$col[1]))
И я хотел бы, чтобы примеры в документации выглядели следующим образом:
#' @examples
#' data(foo)
#' functionThatUsesFoo(foo)
Если я пытаюсь вызывать данные (foo) при разработке пакета, я получаю ошибку "набор данных" foo "не найден". Однако, если я создам пакет, устанавливаю его и загружаю, то я могу сделать тесты и примеры работать.
Мои текущие задачи - не запускать пример:
#' @examples
#' \dontrun{data(foo)}
#' \dontrun{functionThatUsesFoo(foo)}
И в тестах предварительно загрузите данные, используя путь, специфичный для моего локального компьютера:
foo <- read.delim(pathToFoo, sep="\t", fill = TRUE, comment.char="#")
bar <- read.delim(pathToBar, sep=";", fill = TRUE, comment.char="#"
expect_that(foo$col[1], equals(bar$col[1]))
Это не кажется идеальным - особенно, поскольку я сотрудничаю с другими людьми, требуя, чтобы все соавторы имели одинаковые полные пути к "foo" и "bar". Кроме того, примеры в документации выглядят так, что они не могут быть запущены, хотя после установки пакета они могут.
Любые предложения? Большое спасибо.
