Можно создать библиотеки C с distutils (см. параметр libraries distutils.core.setup), но вам, возможно, придется дублировать параметры, которые уже находятся в Makefile, поэтому проще всего сделать это, чтобы расширить установить команду, как описано в других ответах, и вызвать make с модулем подпроцесса.