Я пытаюсь построить графики, используя древовидные данные, где узлы обычно разбиваются нa > 2 ребра. Я пробовал различные макеты, и я вижу, что параметр layout.reingold.tilford будет генерировать древовидные графики с небиффицирующими данными. Однако результаты не особенно привлекательны. Я бы предпочел использовать что-то вроде layout.lgl или layout.kamada.kawai, поскольку они создают более радиальные структуры. Я не вижу, как изменить параметры в R, так что эти деревья не имеют перекрывающихся ребер. Возможно ли это?
Я импортировал простой файл данных в формате Pajek, с 355 узлами и 354 ребрами. В настоящее время я печатаю его, используя:
plot.igraph(g,vertex.size=3,vertex.label=NA,layout=layout.lgl)
Это дает мне такой результат, который хорош, но все же имеет перекрывающиеся края. Я прочитал, что вы можете вручную исправить это с помощью tkplot или другой программы, такой как cytoscape, однако у меня их довольно много, и их размер затрудняет ручную коррекцию.
Большое спасибо.