Я создаю очень большой сайт на основе MVC на базе MVC, который будет иметь большую библиотеку php-классов, javascripts и многие файлы css (не говоря уже о большом количестве файлов для MVC).
Впервые я на самом деле трачу время на планирование чистой и организованной структуры каталогов.
Какие структуры каталогов вы обычно используете, и что будет проще для manuever, когда есть тысячи файлов?