В мире пакета статистики R rgl позволяет мне создавать 3D-графики, которые я могу вращать с помощью мыши. Есть ли способ экспортировать эти графики в переносном формате, загружать их в веб-браузере или другом стороннем инструменте и поворачивать их там? Меня особенно интересует решение для веб-браузера, так как это позволит мне делиться сюжетами с внутренней вики.
Если rgl не позволяет этого, существуют ли другие библиотеки или стратегии, которые позволили бы мне выполнить это?
Вы можете попробовать пакет vrmlgen. Он будет создавать 3d VRML файлы, которые могут отображаться с помощью плагина браузера; вы можете найти плагин в VRML-плагин и детектор браузера.
Как только вы установили плагин, попробуйте следующее:
require(vrmlgen)
example(bar3d)
NB: код примера не был автоматически открыт в браузере для меня (RStudio, Win7, Chrome), потому что путь был искажен. Вам может потребоваться использовать:
require(stringr)
browseURL(str_replace_all(file.path(outdir, 'barplot.html'), fixed('\\'), '/'))
Если вы не хотите устанавливать плагин VRML, вместо этого вы можете использовать X3DOM. Вам понадобится конвертер, но ваши пользователи должны иметь возможность просматривать их только с помощью (современного) браузера. Возможно, вам придется изменить следующий код, чтобы получить правильные пути:
setwd(outdir)
aopt <- 'C:/PROGRA~1/INSTAN~1/bin/aopt' # Path to conversion program
vrml <- 'barplot.wrl'
x3dom <- 'barx.html'
command <- paste(aopt, '-i', vrml, '-N', x3dom)
system(command)
# LOG Avalon Init: 47/616, V2.0.0 build: R-21023 Jan 12 2011
# LOG Avalon Read url
# LOG Avalon Read time: 0.074000
# ============================================
# Call: writeHTML with 1 param
# Write raw-data to barx.html as text/html
# WARNING Avalon Run NodeNameSpace "scene" destructor and _nodeCount == 3
# WARNING Avalon Try to remove nodes from parents
# WARNING Avalon PopupText without component, cannot unregister
# WARNING Avalon Avalon::exitSystem() call and node/obj left: 0/3331
browseURL(file.path(outdir, 'barx.html'))
setwd(curdir)
Для простого решения попробуйте это...
x <- sort(rnorm(1000))
y <- rnorm(1000)
z <- rnorm(1000) + atan2(x,y)
plot3d(x,y,z,
col=rainbow(1000),
type = "s",
size=1,
xlab = "x",
ylab = "y",
zlab = "z",
box=T)
# This writes a copy into temporary directory 'webGL', and then displays it
browseURL(paste("file://", writeWebGL(dir=file.path("C:/Your-Directory-Here/", "webGL"), width=700), sep=""))
откройте файл index.html в Firefox или аналогичном браузере, который поддерживает HTML5 и WebGL
Предложение Пита стоит щедрости. Взаимный вызов не нужен, довольно легко сгенерировать xml файл с помощью sprintf и друзей.
Проблема в скорости: для сравнения у меня была МРТ с цветовым кодом с 17000 сферами (для вокселей), которая была довольно отзывчива на моем экране с помощью rgl.
Когда я поместил его в x3dom, система застыла. Сокращенный набор с 450 сферами работает:
http://www.menne-biomed.de/uni/x3dsample.html
Поддержка браузера несовместима. Некоторые примеры на странице примера x3dom лучше всего работают (верьте или нет) Internet Explorer + Flash 11. Проверьте пример динамического освещения.
Мой пример работает, но выглядит на Firefox 7.0.1. Лучше всего всегда Chrome.
Добавлено позже: Вот еще один пример:
Файл x3d, содержащийся в нем, может отображаться даже с встроенной графикой, используя средство просмотра мгновенных реальностей. Файл html, созданный из него, иногда загружается, но не может быть повернут.
Чтобы динамически взаимодействовать с графиком на веб-странице, вам понадобится какой-то тип java или flash-программы для взаимодействия, а затем R-код/данные, которые могут быть поняты этой программой. Этот вопрос и его ответы выглядят как хорошее место для начала.
Для максимальной гибкости мне повезло с помощью Обработка. Он был первоначально написан в java, но теперь он стабильно портирован на javascript и более экспериментально на python и даже на несколько других.
http://processingjs.org
http://processing.org
Он использует элемент HTML5 <canvas> для обработки вашего кода обработки на лету. Вы можете либо ссылаться на ваш код визуализации в другом файле, либо записывать его прямо в свой html файл (напоминает мне Sweave!).
Кроме того, в Интернете есть огромный ресурс примеров с открытым исходным кодом. Например:
Наконец, вот суть, которую я собрал, чтобы продемонстрировать базовую настройку. Просто скачайте файл processing.js в ту же папку, что и сам gist, и откройте свой браузер.
https://gist.github.com/1295842
Это будет выглядеть так:
Пару миллионов лет назад (ОК, 2005) Я написал код R, чтобы сбрасывать графические примитивы в графическом формате Mathematica (!!), который затем можно было встроить и просмотреть с помощью LiveGraphics3D Плагин Java. Я не пытался использовать его через 6 лет, но я мог бы попытаться воскресить его, если бы был интерес.
PS здесь приведены результаты help(package="LG3d"):
get.live.jar Download live.jar Java archive
LG.display Display Live3D graphics in a browser
LG.html.head header and footer files for LiveGraphics HTML
files
LGmobius Draw a 3D mobius strip
LG.open open and close LiveGraphics3D files
LG.plot.profiles Plot likelihood surface + profiles using
Live3D
LGtorus Draw a torus in LG graphics system
LGtoruswrap Utility functions for LGtorus
mma.brace Low-level graphics primitives for
LiveGraphics3D
mma.edge change edge style
mma.persp Output a perspective plot to a LiveGraphics3D
file
mma.point Medium-level graphics primitives for
LiveGraphics3D
mma.polygon draw a Mma/LG3d polygon