Подтвердить что ты не робот

Изготовление knitr опционально

При написании статьи я обычно использую knitr для встраивания таблиц и графиков, которые я генерирую в R. Все это отлично работает для меня. Тем не менее, некоторые из моих соавторов не так восторженно относятся к этому документообороту и предпочли бы просто оставить взаимодействие с knitr для меня и сосредоточиться на написании своих разделов, не беспокоясь о R-коде. Им также не нужно было бы устанавливать R, RStudio и различные пакеты.

Итак, есть ли способ набора документов LaTeX со встроенными фрагментами knitr без необходимости запускать их через R в первую очередь? Другими словами, можно просто игнорировать куски во время процесса набора (или, возможно, заменить их фиктивными таблицами/графиками)?

4b9b3361

ОТВЕТЫ

Ответ 1

Обновление: пересмотренное описание здесь

Это не отвечает на точный вопрос, но может быть и в случае использования. Недавно у меня была аналогичная задача: я хотел объединить запись и анализ в одном файле .rnw, но мои соавторы не хотели использовать R/RStudio/GitHub/LaTeX.

Итак, я решил поделиться с ними вложенной папкой моего git репо с помощью Dropbox. Эта папка содержит три файла .docx: introduction.docx, methods.docx и discussion.docx (я пишу раздел результатов в файле .rnw). Единственный улов в том, что они должны использовать некоторые очень простые LaTeX при написании, например \subsection{heading} для заголовков, \cite{key} для ссылок, `quotes '', escaping \%,\$и\&.

Вернувшись в файл .rnw, я конвертирую файлы .docx в .txt:

system("textutil -convert txt introduction.docx")

а затем переименуйте расширение файла с .txt на .tex:

file.rename("introduction.txt", "introduction.tex")

Затем за пределами фрагментов кода R я вызываю файлы .tex с помощью:

\input{introduction}

Я отправил небольшой пример в GitHub.

\documentclass{article}
\makeatletter
\renewcommand{\@biblabel}[1]{\quad#1.}
\makeatother
\date{}
\bibliographystyle{plain}

\begin{document}

\begin{flushleft}
{\Large
\textbf{My Title}
}
\end{flushleft}

\section{Introduction}
% do not write in this section...let collaborators write in introduction.docx

<<intro, include=FALSE>>=
# assumes wd set to root folder collaborate
# convert docx to txt
  system("textutil -convert txt introduction.docx")
# rename txt to tex
  file.rename("introduction.txt", "introduction.tex")
@

% pull in introduction.tex
\input{introduction}

\section{Methods}
<<methods, include=FALSE>>=
  system("textutil -convert txt methods.docx")
  file.rename("methods.txt", "methods.tex")
@

\input{methods}

\section{Results}

<<results>>=
  dat <- data.frame(x=runif(30, 0, 30))
  mean <- mean(dat$x, na.rm=TRUE)
@

The mean is \Sexpr{round(mean, 1)}.

\section{Discussion}
<<discussion, include=FALSE>>=
  system("textutil -convert txt discussion.docx")
  file.rename("discussion.txt", "discussion.tex")
@

\input{discussion}

\bibliography{example.bib}
\end{document}