Подтвердить что ты не робот

Как написать тест для графика ggplot

У меня есть много функций, которые генерируют графики, обычно с ggplot2. Сейчас я создаю сюжет и тестирую основные данные. Но я хотел бы знать, есть ли разумный способ проверить, что сюжет содержит слои/параметры, которые я ожидаю, или что графические элементы соответствуют ожиданиям.

Например:

library(ggplot2)
library(scales) # for percent()
library(testthat)

df <- data.frame(
  Response = LETTERS[1:5],
  Proportion = c(0.1,0.2,0.1,0.2,0.4)
)

#' @export plot_fun
plot_fun <- function(df) {
  p1 <- ggplot(df, aes(Response, Proportion)) +
    geom_bar(stat='identity') + 
    scale_y_continuous(labels = percent)
return(p1)
}

test_that("Plot returns ggplot object",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_is(p,"ggplot")
})

test_that("Plot uses correct data", {
  p <- plot_fun(df)
  expect_that(df, equals(p$data))

})

Вот где я застрял

test_that("Plot layers match expectations",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_that(...,...)
})

test_that("Scale is labelled percent",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_that(...,...)
})

Возможно, существует более прямой подход?

4b9b3361

Ответ 1

Это похоже на то, на что вы нацеливаетесь, хотя конкретные требования к построению параметров и содержимого будут варьироваться, конечно. Но для примера, который вы хорошо подготовили выше этих тестов, все должны пройти:

##  Load the proto library for accessing sub-components of the ggplot2
##    plot objects:
library(proto)

test_that("Plot layers match expectations",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_is(p$layers[[1]], "proto")
  expect_identical(p$layers[[1]]$geom$objname, "bar")
  expect_identical(p$layers[[1]]$stat$objname, "identity")
})

test_that("Scale is labelled 'Proportion'",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_identical(p$labels$y, "Proportion")
})

test_that("Scale range is NULL",{
  p <- plot_fun(df)
  expect_null(p$scales$scales[[1]]$range$range)
})

Этот вопрос и его ответы дают хорошую отправную точку для других способов охарактеризовать объекты ggplot, если у вас есть другие вещи, которые вы хотели бы проверить.

Ответ 2

Стоит отметить, что пакет vdiffr предназначен для сравнения графиков. Хорошей особенностью является то, что он интегрируется с пакетом testthat - он фактически используется для тестирования в ggplot2 - и у него есть надстройка для RStudio, которая помогает управлять вашим testuite.

Ответ 3

То, что я также нахожу полезным в дополнение к существующим ответам, заключается в том, чтобы проверить, действительно ли график может быть напечатан.

library(ggplot2)
library(scales) # for percent()
library(testthat)

# First, 'correct' data frame
df <- data.frame(
    Response   = LETTERS[1:5],
    Proportion = c(0.1,0.2,0.1,0.2,0.4)
)

# Second data frame where column has 'wrong' name that does not match aes()
df2 <- data.frame(
    x          = LETTERS[1:5],
    Proportion = c(0.1,0.2,0.1,0.2,0.4)
)

plot_fun <- function(df) {
    p1 <- ggplot(df, aes(Response, Proportion)) +
        geom_bar(stat='identity') + 
        scale_y_continuous(labels = percent)
    return(p1)
}

# All tests succeed
test_that("Scale is labelled 'Proportion'",{
    p <- plot_fun(df)
    expect_true(is.ggplot(p))
    expect_identical(p$labels$y, "Proportion")

    p <- plot_fun(df2)
    expect_true(is.ggplot(p))
    expect_identical(p$labels$y, "Proportion")
})

# Second test with data frame df2 fails
test_that("Printing ggplot object actually works",{
    p <- plot_fun(df)
    expect_error(print(p), NA)

    p <- plot_fun(df2)
    expect_error(print(p), NA)
})
#> Error: Test failed: 'Printing ggplot object actually works'
#> * `print(p)` threw an error.
#> Message: object 'Response' not found
#> Class:   simpleError/error/condition