Im пытается подогнать и построить модель Вейбулла для данных о выживании. Данные имеют только одну ковариацию, когорту, которая работает с 2006 по 2010 год. Итак, какие-либо идеи о том, что добавить к двум строкам кода, которые следует, чтобы построить кривую выживаемости когорты 2010 года?
library(survival)
s <- Surv(subSetCdm$dur,subSetCdm$event)
sWei <- survreg(s ~ cohort,dist='weibull',data=subSetCdm)
Выполнение этого же с моделью Cox PH довольно просто, со следующими строками. Проблема в том, что survif() не принимает объекты типа revreg.
sCox <- coxph(s ~ cohort,data=subSetCdm)
cohort <- factor(c(2010),levels=2006:2010)
sfCox <- survfit(sCox,newdata=data.frame(cohort))
plot(sfCox,col='green')
Используя данные легкие (из пакета выживания), вот что я пытаюсь выполнить.
#create a Surv object
s <- with(lung,Surv(time,status))
#plot kaplan-meier estimate, per sex
fKM <- survfit(s ~ sex,data=lung)
plot(fKM)
#plot Cox PH survival curves, per sex
sCox <- coxph(s ~ as.factor(sex),data=lung)
lines(survfit(sCox,newdata=data.frame(sex=1)),col='green')
lines(survfit(sCox,newdata=data.frame(sex=2)),col='green')
#plot weibull survival curves, per sex, DOES NOT RUN
sWei <- survreg(s ~ as.factor(sex),dist='weibull',data=lung)
lines(survfit(sWei,newdata=data.frame(sex=1)),col='red')
lines(survfit(sWei,newdata=data.frame(sex=2)),col='red')