Я хочу знать, в какой степени измерение/параметр вносит вклад в один из вычисленных основных компонентов.
Описание в реальном мире:
- У меня есть пять климатических параметров для географического распределения вида.
- Я выполнил PCA с этими пятью параметрами
- график PC1 и PC2 показывает интересный образец
Вопрос: Как получить процент вклада (каждого параметра) на каждый ПК?
Что я ожидаю: PC1 составлен до 30% от параметра1, до 50% от параметра2, до 20% от параметра3, 0% от параметра4 и 0% от параметра5. PC2 составлен...
Пример с 5 фиктивными параметрами:
a <- rnorm(10, 50, 20)
b <- seq(10, 100, 10)
c <- seq(88, 10, -8)
d <- rep(seq(3, 16, 3), 2)
e <- rnorm(10, 61, 27)
my_table <- data.frame(a, b, c, d, e)
pca <- princomp(my_table, cor=T)
biplot(pca) # same: plot(pca$scores[,1], pca$scores[,2])
pca
summary(pca)
Где моя информация скрыта?