Файл .sconsign.dblite - это временная база данных, используемая SCons для хранения подписи файлов для ускорения будущих сборок. Если вы удалите его, SCons воссоздает его (и из-за этого ваша следующая сборка может занять немного больше времени). Он не должен находиться под контролем версий.