Я пробовал несколько команд (FLUSH LOGS, PURGE MASTER), но ни один из них не удаляет файлы журнала (если они были ранее активированы) или таблицы журналов (mysql/slow_log.CSV и mysql/general_log.CSV и их .frm и .CSM-копии).
SHOW BINARY LOGS возвращает "Вы не используете двоичный журнал".
Изменить. Я нашел это простое решение для очистки журналов таблицы (но еще не журнала файлов с помощью команды mysql):
TRUNCATE mysql.general_log;
TRUNCATE mysql.slow_log;