В любом случае, чтобы сохранить закрепленные окна между закрытием визуальной студии?
В настоящий момент, если вы закроете окно, когда вы закроете визуальную студию и снова откройте ее, закрепленный статус указанного окна будет reset, и он снова будет включен во все остальные окна.