У меня есть R script, который сохраняет некоторые графики, используя ggsave. Когда я запускаю script из командной строки, он не только сохраняет мои графики, но и пустой файл Rplots.pdf. Как я могу предотвратить создание R этого ненужного файла?
Вот пример script, который воспроизводит ошибку:
#!/usr/bin/env Rscript
# Code that creates unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
ggsave('example.png', my.plot)
Все следующие способы запуска script создают ненужный файл:
Rscript script.R
Rscript --vanilla script.R
chmod a+x script.R
./script.R
Кроме того, когда я отправляю код из интерактивного сеанса, открывается ненужное пустое окно R Graphics Device.
Кроме того, у меня нет этих проблем, если вместо ggsave я использую следующий более подробный код:
#!/usr/bin/env Rscript
# Code that does NOT create unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
png(file = 'example.png')
print(my.plot)
dev.off()
Вот моя информация о сеансе (что то же самое, работает ли Rscript или интерактивно):
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=C LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] methods stats graphics grDevices utils datasets base
other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.3.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] colorspace_1.2-2 dichromat_2.0-0 digest_0.6.3 grid_3.0.1
[5] gtable_0.1.2 labeling_0.1 MASS_7.3-26 munsell_0.4
[9] plyr_1.8 proto_0.3-10 RColorBrewer_1.0-5 reshape2_1.2.2
[13] scales_0.2.3 stringr_0.6.2