Numpy.savetxt приводит к ошибке несоответствия форматирования в python 3.5

Я пытаюсь сохранить матрицу numpy (Nx3, float64) в txt файл с помощью numpy.savetxt:

np.savetxt(f, mat, fmt='%.5f', delimiter=' ')

Эта строка работала в python 2.7, но в python 3.5 я получаю следующую ошибку:

TypeError: несоответствие между массивом dtype ('float64') и форматом specifier ('%.5f%.5f%.5f')

Когда я вхожу в код savetxt, напечатайте ошибку (traceback.format_exc()) в блоке catch (numpy.lib.npyio, строка 1158), ошибка совершенно другая:

Аргумент TypeError: write() должен быть str, а не байтами

Строка кода, приводящая к этому исключению, следующая:

fh.write(asbytes(format % tuple(row) + newline))

Я попытался удалить asbytes, и, похоже, исправил эту ошибку. Это ошибка в numpy?

Ответ 1

savetxt открывает файл в режиме wb и, таким образом, записывает все как байты.

Если вместо этого я открою файл с 'w', я получу вашу вторую ошибку:

In [403]: x=np.ones((3,3),dtype=np.float64)
In [404]: with open('test.txt','w') as f:
    np.savetxt(f,x,fmt='%.5f')
   .....:     
TypeError: must be str, not bytes

Но нет проблем с

In [405]: with open('test.txt','wb') as f:
    np.savetxt(f,x,fmt='%.5f')
   .....:     
In [406]: cat test.txt
1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000

Это на Py3.4; У меня нет numpy, установленного с моим 3.5 Python. Но я не ожидал бы разницы.

ли

'%.5f'%1.2342

работать в вашей системе? Вы также можете попробовать

'%.5f %.5f %.5f'%tuple(mat[0,:])