Я использую пакет R (Анализ филогенетики и эволюции) в R, который имеет функциональность рисования дендрограмм. Я использую следующие команды для чтения данных в формате Newick и рисую дендрограмму, используя функцию plot:
library("ape")
gcPhylo <-read.tree(file = "gc.tree")
plot(gcPhylo, show.node.label = TRUE)
Поскольку набор данных довольно большой, невозможно увидеть какие-либо детали на нижних уровнях дерева. Я вижу только черные области, но никаких деталей. Я вижу только несколько уровней сверху, а потом никаких подробностей.
Мне было интересно, есть ли возможность масштабирования функции графика. Я попытался ограничить область, используя xLim и yLim, однако, они просто ограничивают область, и не увеличивают масштаб, чтобы сделать детали видимыми. Либо увеличение, либо отображение деталей без изменения масштаба решит мою проблему.
Я также признателен за знакомство с любым другим пакетом, функцией или инструментом, который поможет мне преодолеть проблему.
Благодарю.