Я немного посмотрел в iOS 9.3 API Diffs, а также искал веб-сайт и форумы разработчиков и не видел ссылок.
Можно ли определить, активен ли Night Shift? Я бы предположил, что приложения, которые требуют истинного цветового тона, хотели бы предупредить пользователя, если бы цвета экрана были дополнены системой.