Ggplot2 - дрожание и позиция

Я пытаюсь воссоздать фигуру из семинара GGplot2 http://dl.dropbox.com/u/42707925/ggplot2/ggplot2slides.pdf.

В этом случае я пытаюсь создать пример 5 с дрожащими точками данных, подверженными уловке. Когда я запускаю код, точки центрируются вокруг правильной строки, но не имеют дрожания.

Вот код непосредственно из презентации.

set.seed(12345)
hillest<-c(rep(1.1,100*4*3)+rnorm(100*4*3,sd=0.2),
       rep(1.9,100*4*3)+rnorm(100*4*3,sd=0.2))
rep<-rep(1:100,4*3*2)
process<-rep(rep(c("Process 1","Process 2","Process 3","Process 4"),each=100),3*2)
memorypar<-rep(rep(c("0.1","0.2","0.3"),each=4*100),2)
tailindex<-rep(c("1.1","1.9"),each=3*4*100)
ex5<-data.frame(hillest=hillest,rep=rep,process=process,memorypar=memorypar, tailindex=tailindex)
stat_sum_df <- function(fun, geom="crossbar", ...) {stat_summary(fun.data=fun, geom=geom, ...) }

dodge <- position_dodge(width=0.9) 
p<- ggplot(ex5,aes(x=tailindex ,y=hillest,color=memorypar)) 
p<- p + facet_wrap(~process,nrow=2) + geom_jitter(position=dodge) +geom_boxplot(position=dodge)  
p

Ответ 1

EDIT. Лучшее решение с ggplot2 версия 1.0.0 с помощью position_jitterdodge. См. Ответ @Didzis Elferts. Обратите внимание, что dodge.width управляет шириной уклонения, а jitter.width управляет шириной дрожания.

Я не уверен, как код создавал граф в pdf.

Но что-то вроде этого приближает вас к тому, что вам нужно?

Преобразуйте tailindex и memorypar в числовое; добавьте их вместе; и результатом является координата x для слоя geom_jitter. Вероятно, это более эффективный способ сделать это. Кроме того, я хотел бы видеть, как уклонение geom_boxplot и geom_jitter и без дрожания приведет к созданию графика в pdf.

library(ggplot2)
dodge <- position_dodge(width = 0.9)
ex5$memorypar2 <- as.numeric(ex5$tailindex) + 
  3 * (as.numeric(as.character(ex5$memorypar)) - 0.2) 

p <- ggplot(ex5,aes(x=tailindex , y=hillest)) +
   scale_x_discrete() +
   geom_jitter(aes(colour = memorypar, x = memorypar2), 
     position = position_jitter(width = .05), alpha = 0.5) +
   geom_boxplot(aes(colour = memorypar), outlier.colour = NA, position = dodge) +
   facet_wrap(~ process, nrow = 2)
p

Ответ 2

В ggplot2 version 1.0.0 есть новая позиция с именем position_jitterdodge(), созданная для такой ситуации. Это положение должно использоваться внутри geom_point(), и там должно быть fill=, используемое внутри aes(), чтобы показать, какой переменной уклониться от ваших данных. Для управления шириной аргумента уклонения dodge.width= следует использовать.

ggplot(ex5,aes(x=tailindex ,y=hillest,color=memorypar,fill=memorypar))  + 
      facet_wrap(~process,nrow=2) + 
      geom_point(position=position_jitterdodge(dodge.width=0.9)) +
      geom_boxplot(fill="white",outlier.colour = NA, 
                        position = position_dodge(width=0.9))