Построение нескольких строк с помощью Bokeh и pandas

Я хотел бы предоставить фреймворк pandas для Bokeh для построения линейной диаграммы с несколькими строками. Ось x должна быть df.index, и каждая df.columns должна быть отдельной строкой.

Это то, что мне хотелось бы сделать:

import pandas as pd
import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show

toy_df = pd.DataFrame(data=np.random.rand(5,3), columns = ('a', 'b' ,'c'), index = pd.DatetimeIndex(start='01-01-2015',periods=5, freq='d'))   

p = figure(width=1200, height=900, x_axis_type="datetime") 
p.multi_line(df)
show(p)

Однако я получаю сообщение об ошибке:

RuntimeError: Missing required glyph parameters: ys

Вместо этого ive удалось сделать это:

import pandas as pd
import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show

toy_df = pd.DataFrame(data=np.random.rand(5,3), columns = ('a', 'b' ,'c'), index = pd.DatetimeIndex(start='01-01-2015',periods=5, freq='d'))   

ts_list_of_list = []
for i in range(0,len(toy_df.columns)):
    ts_list_of_list.append(toy_df.index)

vals_list_of_list = toy_df.values.T.tolist()

p = figure(width=1200, height=900, x_axis_type="datetime") 
p.multi_line(ts_list_of_list, vals_list_of_list)
show(p)

Это (неуместно) выполняет эту работу, но использует один и тот же цвет для всех трех строк, см. ниже:

Вопросы:

1) как я могу передать pandas dataframe для bokeh multi_line?

2) Если это невозможно напрямую, как я могу манипулировать данными dataframe, чтобы multi_line создавала каждую строку с другим цветом?

заблаговременно

Ответ 1

Вам нужно предоставить список цветов для multi_line. В вашем примере вы бы сделали что-то вроде этого:

p.multi_line(ts_list_of_list, vals_list_of_list, line_color=['red', 'green', 'blue'])

Здесь более общая модификация вашего второго примера, которая делает больше или меньше того, что вы закончили, но немного более кратким и, возможно, более Pythonic:

import pandas as pd
import numpy as np
from bokeh.palettes import Spectral11
from bokeh.plotting import figure, show, output_file
output_file('temp.html')

toy_df = pd.DataFrame(data=np.random.rand(5,3), columns = ('a', 'b' ,'c'), index = pd.DatetimeIndex(start='01-01-2015',periods=5, freq='d'))   

numlines=len(toy_df.columns)
mypalette=Spectral11[0:numlines]

p = figure(width=500, height=300, x_axis_type="datetime") 
p.multi_line(xs=[toy_df.index.values]*numlines,
                ys=[toy_df[name].values for name in toy_df],
                line_color=mypalette,
                line_width=5)
show(p)

который дает:

Ответ 2

Вам нужно построить график временных рядов. Это позволит вам легко вставить легенду. Атрибут TimeSeries может быть расположен под именем bokeh._legacy_charts. См. Следующий пример:

http://bokeh.pydata.org/en/0.9.3/docs/user_guide/charts.html