Добавить легенду на "geom_bar", используя пакет ggplot2

Я новичок в R, поэтому, пожалуйста, простите мое невежество. Я сделал псевдонаучный барплот, в котором я нарисовал 4 набора баров друг на друга, используя geom_bar. Существует 4 категории статуса здоровья (живые, мертвые, инфицированные и дерновые) для трех видов дубов (QUAG, QUKE, QUCH).

Мой код выглядит следующим образом:

x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), alive = c(627,208,109),  infected = c(102,27,0), dead = c(133,112,12), sod.dead=c(49,8,0)))

x.plot = ggplot(x, aes(variable, alive)) + geom_bar(fill="gray85") + 
  geom_bar(aes(variable,dead), fill="gray65") +
  geom_bar(aes(variable, infected), fill="gray38") +
  geom_bar(aes(variable, sod.dead), fill="black")+
  opts(panel.background = theme_rect(fill='gray100'))
x.plot

Теперь я хочу создать легенду, которая показывает, какой оттенок серого относится к статусу дерева, т.е. "gray65" - это "мертвые деревья" и т.д. Я пробовал последний час и не могу получить его работа.

Ответ 1

Я вижу, что @Brandon Bertelsen опубликовал отличный ответ. Я хотел бы добавить код, в котором рассматриваются дополнительные сведения, упомянутые в исходном сообщении:

После того, как вы измените свои данные и присвоите статус здоровья fill, ggplot автоматически создаст легенду.
Я предлагаю использовать scale_fill_manual() для получения точных граней, упомянутых в исходном сообщении.
theme_bw() - удобная функция, позволяющая быстро получить черно-белый вид вашего сюжета.
Порядок построения коэффициентов уровней/цветов можно контролировать, указав желаемый порядок с аргументом levels factor().
Уклоненный барплот (вместо штабелирования) может иметь некоторые преимущества для этого набора данных.

library(reshape2)
library(ggplot2)

x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), 
                        alive=c(627, 208, 109),  infected=c(102, 27, 0), 
                        dead=c(133, 112, 12), sod.dead=c(49, 8, 0)))

# Put data into 'long form' with melt from the reshape2 package.
dat = melt(x, id.var="variable", variable.name="status")

head(dat)
#    variable   status value
# 1      QUAG    alive   627
# 2      QUKE    alive   208
# 3      QUCH    alive   109
# 4      QUAG infected   102
# 5      QUKE infected    27
# 6      QUCH infected     0

# By manually specifying the levels in the factor, you can control
# the stacking order of the associated fill colors.
dat$status = factor(as.character(dat$status), 
                    levels=c("sod.dead", "dead", "infected", "alive"))

# Create a named character vector that relates factor levels to colors.
grays = c(alive="gray85", dead="gray65", infected="gray38", sod.dead="black")

plot_1 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) +
         theme_bw() +
         geom_bar(position="stack") +
         scale_fill_manual(values=grays)

ggsave(plot=plot_1, filename="plot_1.png", height=5, width=5)

# You may also want to try a dodged barplot.
plot_2 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) +
         theme_bw() +
         geom_bar(position="dodge") +
         scale_fill_manual(values=grays)

ggsave(plot=plot_2, filename="plot_2.png", height=4, width=5)

Ответ 2

Вам нужно изменить свои данные.

library(reshape)
library(ggplot2)

x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), alive = c(627,208,109),  infected = c(102,27,0), dead = c(133,112,12), sod.dead=c(49,8,0)))

x <- melt(x)
colnames(x) <- c("Type","Status","value")

ggplot(x, aes(Type, value, fill=Status)) + geom_bar(position="stack")