Как я могу выровнять латексные уравнения в R Markdown?

У меня возникают трудности с выравниванием уравнений в R Markdown (т.е. сложение уравнения на левой стороне страницы и выравнивание последующих строк). Я вообще решил, что хочу установить параметр [fleqn] в пакете amsmath, чтобы выровнять все уравнения, но при этом следующее в моем заголовке YAML дает ошибку

'Опция clash для пакета amsmath'

---
author: "ME"
date: "February 26, 2015"
header-includes:
  - \usepackage[fleqn]{amsmath}
output: pdf_document
---

Раздел из моего документа:

$$
\begin{aligned}
Bias(\hat{\theta})  &= E(\hat{\theta}) - \theta \\
                    &= E(2 \bar{X} -1) - \theta \\
                    &= \frac{2}{n}\sum_{i=1}^n E(X_i) -1 -\theta \\
                    &= 2E(X) - 1 - \theta \\
                    &= 2 \cdot \frac{\theta+1}{2} - 1 - \theta \\
                    &= 0 \\
\end{aligned}
$$

Спасибо

Ответ 1

Попробуйте использовать $...$ вместо $$...$$.

В случае $$...$$ в Rmarkdown по умолчанию выравнивается по центру

Ответ 2

Этот вопрос уже задан здесь: R Markdown Math Equation Allignment

Ниже для меня работает:

$\begin{aligned}
Bias(\hat{\theta})  &= E(\hat{\theta}) - \theta \\
                    &= E(2 \bar{X} -1) - \theta \\
                    &= \frac{2}{n}\sum_{i=1}^n E(X_i) -1 -\theta \\
                    &= 2E(X) - 1 - \theta \\
                    &= 2 \cdot \frac{\theta+1}{2} - 1 - \theta \\
                    &= 0 \\
\end{aligned}$

Ответ 3

$ L(x_{1}, x_{2}, ..., x_{n}| \mu) =  \mu * (1-\mu) $

$log (\ L(x_{1}, x_{2}, ..., x_{n}| \mu)) = h * log(\mu) + (m-h) * log(1-\mu) $

$\frac{\partial  log(\ L(x_{1}, x_{2}, ..., x_{n}| \mu)}{\partial(\mu)}  = \frac{h}{\mu} + \frac{h-m}{1-\mu} $

#### We set this to zero to find the value that maximizes the likelihood 

$\frac{h}{\mu} + \frac{h-m}{1-\mu} = 0 $

$h = m * \mu $

$\mu = \frac{h}{m} $