Подтвердить что ты не робот

Как отобразить выбросы и оригинальные серии?

Привет. Я хотел бы определить функцию, которая возвращает график для outlier (определенный ниже) на основе specified date range и одновременно отображает исходную серию (и учетные записи в этом контексте для возможных отношений):

Отказ от выбросов:

  anomaly <- function(x)
               {   tt <- 1:length(x)  
                   resid <- residuals(loess(x ~ tt)) 
                   resid.q <- quantile(resid,prob=c(0.25,0.75)) 
                   iqr <- diff(resid.q) 
                   limits <- resid.q + 1.5*iqr*c(-1,1)  
                   score <- abs(pmin((resid-limits[1])/iqr,0) + pmax((resid -                   limits[2])/iqr,0)) 

                   return(score)
            }
   # defining dates
     dates <- as.POSIXct(seq(as.Date("2015-08-20"), as.Date("2015-10-08"), by = "days"))

Некоторые данные:

     a<-runif(50, 5.0, 7.5)
     b<-runif(50, 4, 8)
     c<-runif(50, 1, 2)
     d<-runif(50, 3, 3.5)
     ca<-c/a
     cb<-c/b
     df<-data.frame(dates,a,b,c,d,ca,cb)

Представляем outlier

       df[49,4]<-0
       df[50,6]<-0

Прокрутите данные, чтобы найти аномалии

      new<-lapply(df[,2:7],anomaly)
       library(stringi) # binding list with differing rows
     # from list to data frame
       res <- as.data.frame((stri_list2matrix(new)))
     # rename columns
       colnames(res) <- names(new)
     # depends on dates at the beginning 
      res<-(cbind(dates,res[,1:6])) 
     # melt to plot
       library(reshape)
       library(reshape2)
       new <- melt(res , id.vars = 'dates', variable.name = 'series')

Отказ от графика с указанным date range (последние 4 дня):

       library(ggplot2)

       nrdays <- 4
       a.plot<-ggplot(subset(new, new$dates >= as.POSIXct(max(new$dates)- (nrdays*60*60*24))),
         aes(x=dates,y=value,colour=variable,group=variable)) + 
         geom_line() + 
         facet_grid(variable ~ ., scales = "free_y")+
         ylab("Outliers")+
         xlab("Date")

Определение функции проверки данных:

          check_data <- function(df) { 
          if(tail(df, 1) > 0) { # check only last date

            return(a.plot)

           # and the corresponding original series

        }
      }
        # check and plot data
          check_data(df)

Моя проблема в том, что у меня есть сотни функций, и мне хотелось бы только заговорить те, где произошел outlier. Как вы можете видеть на графике, я могу придумать сюжет, который возвращает все временные ряды, включая серию с outlier, а также те, где имелся только outlier. Кроме того, я хотел бы также сообщить об исходной серии (включая ratios, т.е. С учетом outlier в соотношении ca я хотел бы получить исходный ряд c и a)... как я могу подойти к этой проблеме. Таким образом, результат может выглядеть так:

including original series:

введите описание изображения здесь

and the outlier as well:

введите описание изображения здесь

4b9b3361

Ответ 1

вам нужно указать в subset, что вы хотите только выбросы, тот, который не равен 0. поэтому вы можете заменить

a.plot<-ggplot(subset(new, new$dates >= as.POSIXct(max(new$dates)- (nrdays*60*60*24)) &  new$variable %in% new$variable[!new$value %in% 0 & new$dates >= as.POSIXct(max(new$dates)- (nrdays*60*60*24))]),
           aes(x=dates,y=value,colour=variable,group=variable)) + 
  geom_line() + 
  facet_grid(variable ~ ., scales = "free_y")+
  ylab("Outliers")+
  xlab("Date")

Это должно помочь. Также вы можете немного очистить его, чтобы он был более читабельным

Другой вариант - присоединиться к исходным данным и выбросам и составить их вместе. Сначала вы создаете data.frame, затем подмножество и передаете его в ggplot. Итак, после вашей петли над данными вы можете сделать что-то вроде этого

orig <- melt(df , id.vars = 'dates', variable.name = 'series')

data.df <- merge(new, orig, by = c("dates", "variable"))
colnames(data.df)[2:4] <- c("group","index", "original")
data.df$index <- as.numeric(as.character(data.df$index)) # replace factor with numeric

nrdays <- 4
data.subs <- subset(data.df, data.df$dates >= as.POSIXct(max(data.df$dates)- (nrdays*60*60*24)) & 
                  data.df$group %in% data.df$group[!data.df$index %in% 0 & data.df$dates >= as.POSIXct(max(data.df$dates)- (nrdays*60*60*24))])
data.subs <- melt(data.subs, id = c('dates', "group"))

a.plot<-ggplot(data.subs)+
  geom_line(aes(x=dates,y=value, colour = variable, group = variable))+
  facet_grid(group ~ ., scales = "free_y")+
  ylab("Outliers")+
  xlab("Date")

a.plot

введите описание изображения здесь