Ответ 1

Не уверен, что этот вопрос все еще активен, но это первый, который появился при поиске "сохранения графиков в блестящем приложении", поэтому я хотел бы быстро добавить, как заставить ggsave работать с downloadHandler по строкам исходного вопроса,

Альтернативные стратегии, предложенные juba с использованием прямого вывода вместо ggsave и альтернативной стратегии, предложенной alexwhan, оба отлично работают, это просто для тех, кто абсолютно хочет использовать ggsave в downloadHandler).

Проблема, о которой сообщает alexwhan, вызвана тем, что ggsave пытается сопоставить расширение файла с правильным графическим устройством. Однако временный файл не имеет расширения, поэтому совпадение не выполняется. Это можно устранить, специально настроив устройство в вызове функции ggsave, например, в примере исходного кода (для png):

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) grDevices::png(..., width = width, height = height, res = 300, units = "in")
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
    }
)

Этот вызов в основном принимает функцию device для png, которую ggsave присваивает внутренне (вы можете посмотреть код функции ggsave, чтобы увидеть синтаксис jpg, pdf и т.д.). Возможно, в идеале можно было бы указать расширение файла (если оно отличается от имени файла - как это имеет место здесь для временного файла) в качестве параметра ggsave, но эта опция в настоящее время недоступна в ggsave.

Минимальный самостоятельный рабочий пример:

library(shiny)
library(ggplot2)
runApp(list(
  ui = fluidPage(downloadButton('foo')),
  server = function(input, output) {
    plotInput = function() {
      qplot(speed, dist, data = cars)
    }
    output$foo = downloadHandler(
      filename = 'test.png',
      content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) {
          grDevices::png(..., width = width, height = height,
                         res = 300, units = "in")
        }
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
      })
  }
))

sessionInfo()
# R version 3.1.1 (2014-07-10)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# 
# locale:
#  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
#  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
#  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
#  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
# [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
# 
# attached base packages:
# [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
# 
# other attached packages:
# [1] ggplot2_1.0.0 shiny_0.10.1 
# 
# loaded via a namespace (and not attached):
#  [1] bitops_1.0-6     caTools_1.17     colorspace_1.2-4 digest_0.6.4    
#  [5] formatR_1.0      grid_3.1.1       gtable_0.1.2     htmltools_0.2.6 
#  [9] httpuv_1.3.0     labeling_0.2     MASS_7.3-34      munsell_0.4.2   
# [13] plyr_1.8.1       proto_0.3-10     Rcpp_0.11.2      reshape2_1.4    
# [17] RJSONIO_1.3-0    scales_0.2.4     stringr_0.6.2    tools_3.1.1     
# [21] xtable_1.7-3    

Update

В версии ggplot2 версии 2.0.0 функция ggsave поддерживает ввод символов для параметра device, что означает, что временный файл, созданный downloadHandler, теперь можно сохранить с помощью прямого вызова ggsave, указав, что используемое расширение должно быть, например, "pdf" (вместо передачи функции устройства). Это упрощает приведенный выше пример к следующему

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = "png")
    }
)

Ответ 2

Здесь решение, которое позволяет использовать ggsave для сохранения блестящих графиков. Он использует логический флажок и ввод текста для вызова ggsave(). Добавьте это в файл ui.R внутри sidebarPanel:

textInput('filename', "Filename"),
checkboxInput('savePlot', "Check to save")

Затем добавьте это в файл server.R вместо текущей функции output$plot reactivePlot:

output$plot <- reactivePlot(function() {
    name <- paste0(input$filename, ".png")
    if(input$savePlot) {
      ggsave(name, plotInput(), type="cairo-png")
    }
    else print(plotInput())
  })

Затем пользователь может ввести нужное имя файла в текстовое поле (без расширения) и пометить флажок для сохранения в каталоге приложения. Снимите флажок, чтобы распечатать график. Я уверен, что есть более простые способы сделать это, но по крайней мере теперь я могу использовать ggsave и cairo в окнах для более приятной графики png.

Пожалуйста, добавьте любые предложения, которые могут быть у вас.

Ответ 3

Мне не удалось заставить его работать с ggsave, но со стандартным вызовом png() это выглядит нормально.

Я только изменил часть output$downloadPlot вашего файла server.R:

 output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      png(file)
      print(plotInput())
      dev.off()
    })

Обратите внимание, что у меня были некоторые проблемы с версией блеска 0,3, но она работает с последним из Github:

library(devtools)
install_github("shiny","rstudio")

Ответ 4

Это старый, но все же лучший удар, когда кто-то googles "R shiny save ggplot", поэтому я буду способствовать другому обходу. Очень просто... вызвать ggsave в той же функции, которая отображает ваш график, который сохранит график как файл на сервере.

output$plot <- renderPlot({
    ggsave("plot.pdf", plotInput())
    plotInput()
})

Затем используйте downloadHandler и используйте file.copy() для записи данных из существующего файла в параметр "файл".

output$dndPlot <- downloadHandler(
    filename = function() {
        "plot.pdf"
    },
    content = function(file) {
        file.copy("plot.pdf", file, overwrite=TRUE)
    }
)

Работает для меня.

Ответ 5

У меня также были проблемы с созданием файла PDF из диаграммы рассеяния, созданной с помощью ggplot в ShinyApp. Я добился успеха с подходом, похожим на тот, который использовался в juba, но тогда используемая мной функция nearPoints() не сработала и выдала сообщение об ошибке, сообщающее что-то о невозможности найти координаты. Затем я использовал опцию ggsave, рекомендованную Yihui Xie, но с этой стратегией я получаю файлы, сохраненные в папке, где находится мой ShinyApp. Я беспокоюсь, что если я попытаюсь использовать это в моем ShinyApp, размещенном на сайте shinyapps.io, возникнут проблемы при попытке сохранить эти временные и временные файлы. Я также попытался удалить файл после завершения загрузки, но каждый раз, когда отображается график, файл создается, поэтому файл создается снова после загрузки скопированного файла. Вот пример кода, который я использовал для кнопки загрузки:

    filename = function() {
      paste('boxPlot_', Sys.Date(), '.pdf', sep='')
    },
    content = function(file) {
      file.copy(paste('boxPlot_', Sys.Date(), '.pdf', sep=''), file, overwrite = TRUE)
      # To avoid the accumulation of PDFs in the server
      file.remove(paste('boxPlot_', Sys.Date(), '.pdf', sep=''))
    }
  )

Я предполагаю, что это может вызвать проблемы, если я загружу скрипт ShinyApp в shinyapps.io, который создает один файл PDF каждый раз при визуализации графика, верно?